Tem um tabuleiro estreito de rampas inclinadas e com três arcos de volta perfeita, sendo o central de maior dimensão.
Faz parte do percurso pedreste da Rota de Santa Águeda.
De planta longitudinal, composta pelo do rectângulo da nave e o quadrado da capela-mor , a que se adossa a Sul o quadrado da sacristia, a Oeste o da galilé e vários anexos rectangulares a Norte e Sul. Volumes articulados com coberturas diferenciadas: telhados de 1, 2, 3 e 4 águas sobre os anexos, nave, capela-mor e galilé respectivamente, domo sobre a sacristia. Fachada principal marcada pela galilé de grandes dimensões, rasgada por 3 arcos, (entaipado o do lado Sul), rebaixados sobre pilastras toscanas em cada uma das faces, coberta por abóbada de arestas; na fachada da igreja um arco cego idêntico aos que vazam a galilé enquadra o portal adintelado moldurado. Nave única de 2 tramos cobertos por abóbadas estreladas, com fechos esculpidos, estribadas em colunas fasciculadas. Grade em ferro separando a nave da capela-mor; arco triunfal em arco quebrado; capela-mor com idêntica cobertura, com a cruz de Cristo e uma estrela de oito pontas nos fechos, estribada em colunas adossadas, com capitéis vegetalistas; no altar-mor frontal de azulejos polícromos seiscentistas, de influência oriental, figurando ramagens e pássaros, centrado pela imagem de São Neutel; retábulo-mor em talha dourada. Sacristia coberta por cúpula sobre trompas.
Todo o interior, alçados e abóbadas, são revestidos por pintura mural a fresco, com várias camadas de intervenção, representando cenas da vida de Santa Águeda e de São Neutel, anjos músicos na capela-mor, vários santos (Santa Luzia, Santa Catarina de Alexandria, Santo André, Santo Agostinho, São Paulo eremita, São Brás, São Luís, Santo Amaro, São Bartolomeu, São Paulo, Santa Maria Madalena, São João Baptista, Santa Rita de Cássia, São Francisco de Assis), a Virgem com O Menino, a Pietà, a Santíssima Trindade, a representação da matança dos inocentes na nave e no alçado do lado evangelho, no 1º tramo da nave, representação de um São Cristovão gigante transportando O Menino.
O conjunto é decorado por pintura mural, com vasta composição de lóbulos, folhagens e doze medalhões hagiográficos, com representação de Santo António, um Santo Papa, São Domingos, São Bento, São Luís e um santo Ermita; tabela ovóide no arco mestre com a data 1631; nos alçados distribuem-se superiormente pinturas alusivas a algumas Obras de Misericórdia corporais: dar de comer a quem tem fome, dar de beber a quem tem sede (numa composição conjunta), dar pousada a peregrinos e pobres, resgatar os cativos, enterrar os mortos e curar os enfermos.
Guarda-vento, com pia de água benta, à entrada, do lado da Epístola, e uma capela lateral no terceiro tramo, de cada lado, com arco de volta perfeita assente em pilastras e camarim envidraçado. Arco triunfal de volta perfeita assente em pilastras e três degraus; capela-mor com cobertura em abóbada de berço, arrancando de cornija, também decorada por composição pictórica, com destaque para as alegorias à Paixão de Cristo, enquanto nos prospectos laterais subsistem as figurações da "Última Ceia" (do lado do Evangelho) e da "Congregação dos Apóstolos" (do lado da Epístola); altar com Senhor Morto jacente, retábulo e sacrário de talha dourada e policromada, com painel de pintura a óleo sobre madeira, representando a "Visitação"; na parede do lado do Evangelho, porta de acesso à sacristia e janela. Arquitectura religiosa, maneirista, barroca. O edifício destaca-se pela profusão e elevada qualidade das pinturas murais que decoram as paredes e as abóbadas, e que são atribuídas a José Escobar.
A Capela serve actualmente de capela mortuária da Vila.